Mustafa Emin Çanakçı 2016 yılında acil tıp uzmanı olmuştur. Türkiye Acil Tıp Derneği EKG Kurs Koordinatörüdür. Eskişehir Osmangazi Üniversitesi Acil Tıp Anabilim Dalında öğretim üyesi olarak görev yapmaktadır.